Diferenças

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--- ecovirt:roteiro:particao:particao_univar [2021/11/16 15:14]
amzmartini [Partição da variação entre ambiente e espaço]
+++ ecovirt:roteiro:particao:particao_univar [2021/11/17 22:09] (atual)
prado [Conclusão]
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 Podemos tentar entender as comunidades analisando cada uma das populações de cada espécie presente ou podemos tentar entender o conjunto de espécies como um todo. Aqui vamos analisar a estrutura espacial da abundância de uma espécie fictícia. Começamos com apenas uma espécie porque isso facilita entender os cálculos e suas interpretações. No roteiro seguinte mostraremos como a partição pode ser generalizada para descrever padrões conjuntos de abundância de muitas espécies.
+=====Preparação para o exercício=====
-===== Importando os dados para o R =====
+Para começar, escolha uma pasta para você guardar os arquivos e resultados deste roteiro em seu computador.
+Copie para essa pasta o arquivo com os dados que vamos usar:
-Para começar, copie  para sua pasta de trabalho o arquivo com os dados que vamos usar:
+  * {{ :ecovirt:roteiro:particao:roteiro1b.csv |}}
-  * {{roteiro1.csv|roteiro1.csv}}
+Em seguida, abra o programa R, clicando no ícone {{:ecovirt:rlogo.png?nolink&30|}} que está na área de trabalho do seu computador.
+Se tudo deu certo até aqui, abrirá uma janela do R como essa:
+{{  tela_inicial_r.png?nolink  }}
+Já com a janela do programa R aberto, o próximo passo será mudar o diretório de trabalho para aquela pasta que você acabou de criar. Com isso será mais fácil importar os dados dos arquivos ".csv" para dentro do ambiente R.
+A mudança de diretório deve ser feita da seguinte forma:
+  * Abra o Menu "Arquivo" (ou "File");
+  * Selecione "Mudar dir" (ou "Change dir");
+  * Escolha a sua pasta na janela que abrir.
+//[Obs. Para Mac, essa opção está no Menu "Misc" e a opção é "Change working dir"]//
+Para checar se você está na pasta correta, copie e cole o comando abaixo na linha de comando do R. Atenção: O comando deve ser colado na frente do símbolo ">", circundado em azul na imagem anterior. Este símbolo indica o início da linha de comando ou "prompt", onde você deve escrever comandos para o R.
+<code>
+getwd()
+</code>
+Após colar, aperte a tecla "enter" e veja se o R retorna o nome da sua pasta. Se sim, ótimo. Se não, chame um monitor ou professor.
+===== Importando os dados para o R =====
 Agora vamos importar para o R os dados que você gravou em seu diretório. Para isso copie o comando abaixo, cole na linha de comando do R e pressione "enter":
 <code>
-dados <- read.csv2("roteiro1.csv")
+dados <- read.csv("roteiro1b.csv")
 </code>
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 ==== Outra hipótese: limitação à dispersão ====
-Uma outra ecóloga sabia que a invasão por //Non illum// era recente e havia começado pelo canto superior direito da parcela por sementes trazidas acidentalmente por tucanos, que desapareceram em seguida ((ao que parece tucanos e patos amarelos dispersam apenas uma vez as sementes, pois morrem envenenados por elas)). A ecóloga então propôs que quadrados mais distantes do ponto de entrada tiveram menores chances de serem colonizados. Essa hipótese propõe que a variação da abundância desta planta observada na parcela é resultado apenas da *limitação à dispersão*. A ecóloga criou então um mapa para expressar sua hipótese. Neste mapa (à direita) os quadrados com maior chance de receber sementes estão em tons mais escuros:
+Uma outra ecóloga sabia que a invasão por //Non illum// era recente e havia começado pelo canto superior direito da parcela por sementes trazidas acidentalmente por tucanos, que desapareceram em seguida ((ao que parece tucanos e patos amarelos dispersam apenas uma vez as sementes, pois morrem envenenados por elas)). A ecóloga então propôs que quadrados mais distantes do ponto de entrada tiveram menores chances de serem colonizados. Essa hipótese propõe que a variação da abundância desta planta observada na parcela é resultado apenas da **limitação à dispersão**. A ecóloga criou então um mapa para expressar sua hipótese. Neste mapa (à direita) os quadrados com maior chance de receber sementes estão em tons mais escuros:
 {{  mapas2.png  }}
@@ Linha 119: / Linha 147: @@
 ===== Partição da variação entre ambiente e espaço =====
-Resumindo o que encontramos até aqui: uma variável ambiental (pH) explica 68,6% da variação da abundância da espécie. Porém, uma variável de estrutura espacial explica 49,2% desta mesma variação. Como é possível que a soma dos percentuais de variação explicada passem de 100% ? 8-O
+Resumindo o que encontramos até aqui: uma variável ambiental (pH) explica 68,6% da variação da abundância da espécie. Porém, uma variável de estrutura espacial explica 65,5% desta mesma variação. Como é possível que a soma dos percentuais de variação explicada passem de 100% ? 8-O
 A resposta é que há uma relação entre o pH e a variável de estrutura espacial:
@@ Linha 139: / Linha 167: @@
 Por fim, a variação total é representada pelo retângulo externo. A parte não coberta pelos círculos é a variação que não é explicada por nenhuma variável, indicada por $d$.
 ==== Variação não explicada ====
@@ Linha 214: / Linha 241: @@
 =====Conclusão=====
+Abaixo o diagram da partição da variação na abundância de //Non illum// nos componentes que definimos neste roteiro:
+{{ :ecovirt:roteiro:particao:venn_univar.png |}}
 <WRAP center round help 60%>

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