Diferenças

Aqui você vê as diferenças entre duas revisões dessa página.

--- ecovirt:roteiro:neutr:neutrar [2016/01/15 18:33]
melina.leite [Uma Metacomunidade mais Realista]
+++ ecovirt:roteiro:neutr:neutrar [2022/10/25 02:31]
127.0.0.1 edição externa
@@ Linha 1: / Linha 1: @@
+<WRAP tabs>
+  * [[ecovirt:roteiro:neutr:neutrarcmdr|{{:ecovirt:logorcmdr01.png?20|}}]]
+  * [[ecovirt:roteiro:neutr:neutrar|{{:ecovirt:rlogo.png?20|}}]]
+</WRAP>
+====== Teoria neutra da biodiversidade - Roteiro no R======
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#teoria_neutra_da_biodiversidade}}
+  * [[ecovirt:roteiro:math:bebador|O Bêbado e o Abismo]]
+  * [[ecovirt:roteiro:math:zerosumr|Um Joguinho Besta]]
+====== A Teoria passo a passo ======
+{{section>ecovirt:roteiro:avisos#roteiro_r}}
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#a_teoria_passo_a_passo}}
+Para simular este processo, temos mais uma super-função no pacote EcoVirtual, chamada ''simHub1'' ((além desta, iremos também usar as funções simHub2 e simHub3)).
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#parametros}}
+Para realizar as simulações com estes parâmetros, copie o comando abaixo e cole na linha de comando do R. Você verá uma animação da dinâmica neutra de mortes e nascimentos. Ao fim dela, você terá um gráfico com o número de espécies na comunidades, ao longo do tempo:
+   simHub1(S = 100, j = 2)
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#sm_simule}}
+Para realizar estas simulações, copie e cole os comandos abaixo na linha de comando do R ((O argumento ''anima=FALSE'' desliga as animações, e aumenta a velocidade de processamento.)) :
+<code>
+simHub1(S = 100, j = 2, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub1(S = 100, j = 4, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub1(S = 100, j = 6, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub1(S = 100, j = 8, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub1(S = 100, j = 10, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub1(S = 100, j = 12, anima = FALSE, cycles =2e4)
+</code>
+==== Questões ====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#sm_perguntas}}
+===== Incluindo Migrações =====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#incluindo_migracoes}}
+Utilize agora a função **simHub2**, que além dos parâmetros da função anterior tem também o parâmetro $m$ para imigração.
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#incluindo_migracoes_cont}}
+Para isto, copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R:
+<code>
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.1, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.2, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.3, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.4, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.5, anima = FALSE, cycles =2e4)
+</code>
+==== Questões ====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#incluindo_migracoes_questoes}}
+===== Uma Metacomunidade mais Realista =====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#uma_metacomunidade_mais_realista}}
+No pacote EcoVirtual a simulação desta dinâmica neutra com uma metacomunidade que também tem uma dinâmica neutra é feita com a função ''simHub3''.
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#parametros_simhub3}}
+Para executar estas simulações,  copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R:
+Para isto, copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R:
+<code>
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.1, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.2, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.3, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.4, anima = FALSE, cycles =2e4)
+simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.5, anima = FALSE, cycles =2e4)
+</code>
+==== Mais algumas explorações ====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#exploracoes_simhub3}}
+====Questões====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#questoes_simhub3}}
+===== Para saber mais =====
+{{section>ecovirt:roteiro:neutr:neutra_base#para_saber_mais}}
+{{tag>R comunidades teoria_neutra}}

Ferramentas do usuário

Ferramentas do site

Diferenças

Ferramentas da página