ecovirt:roteiro:neutr:biogeo_base
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ecovirt:roteiro:neutr:biogeo_base [2020/02/07 13:37] prado |
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| Linha 278: | Linha 278: | ||
| E resolvendo para a condição de equilíbrio $${dS}/{dt}\ =0$$ temos: | E resolvendo para a condição de equilíbrio $${dS}/{dt}\ =0$$ temos: | ||
| - | $$\hat S \ = \ \frac{ I P }{I+E}$$ | + | $$\widehat{S } \ = \ \frac{ I P }{I+E}$$ |
| - | $$\hat T \ = \ \frac{ I E }{I+E}$$ | + | $$\widehat{T} \ = \ \frac{ I E }{I+E}$$ |
| - | que são, respectivamente, o número de espécies no equilíbrio ($\hat S$) e a taxa de substituição de espécies no equilíbrio ($ \hat T$). Note que este não é um equilíbrio estático quanto à composição, isto é, apesar de o número de espécies permanecer constante, a composição de espécies está sempre se alterando, com novas espécies chegando e velhas espécies se extinguindo. | + | que são, respectivamente, o número de espécies no equilíbrio ($\widehat{S}$) e a taxa de substituição de espécies no equilíbrio ($ \widehat{T}$). Note que este não é um equilíbrio estático quanto à composição, isto é, apesar de o número de espécies permanecer constante, a composição de espécies está sempre se alterando, com novas espécies chegando e velhas espécies se extinguindo. |
| Linha 293: | Linha 293: | ||
| Nosso segundo exemplo será o de duas ilhas de mesmo tamanho, mas que estão a distâncias diferentes da costa,como no fundo da figura ao lado (**B**). Neste caso como têm praticamente a mesma área, as duas ilhas tem taxas de extinção semelhantes. Agora o problema passa a ser a chegada de novos propágulos: é razoável supor que quanto mais distante uma ilha fôr do continente, menor a taxa de imigração. | Nosso segundo exemplo será o de duas ilhas de mesmo tamanho, mas que estão a distâncias diferentes da costa,como no fundo da figura ao lado (**B**). Neste caso como têm praticamente a mesma área, as duas ilhas tem taxas de extinção semelhantes. Agora o problema passa a ser a chegada de novos propágulos: é razoável supor que quanto mais distante uma ilha fôr do continente, menor a taxa de imigração. | ||
| - | ====== Parametros ====== | + | ====== Parâmetros ====== |
| Esta função traça as retas de extinção e colonização para cada ilha, dadas as áreas e distâncias das ilhas. Para isso, a função calcula primeiro as taxas de extinção e colonização máximas de cada ilha, como funções lineares de suas áreas e distâncias ao continente, respectivamente. Os argumentos da função: | Esta função traça as retas de extinção e colonização para cada ilha, dadas as áreas e distâncias das ilhas. Para isso, a função calcula primeiro as taxas de extinção e colonização máximas de cada ilha, como funções lineares de suas áreas e distâncias ao continente, respectivamente. Os argumentos da função: | ||
| Linha 299: | Linha 299: | ||
| ^Opção ^Parâmetro^Significado^ | ^Opção ^Parâmetro^Significado^ | ||
| |''Mainland Number of Species''|P |número de espécies colonizadoras do continente| | |''Mainland Number of Species''|P |número de espécies colonizadoras do continente| | ||
| - | |''Extinction/Area coefficient''| b.e|inclinação da relação linear entre taxa de extinção e área. | | + | |''Extinction/Area coefficient''| b.e|inclinação da relação linear entre taxa máxima de extinção $E$ e área da ilha. | |
| - | |''Extinction/Distance coefficient''|h.e |inclinação da relação linear entre taxa de extinção e distância. | | + | |''Extinction/Distance coefficient''|h.e |inclinação da relação linear entre taxa máxima de extinção $E$ e distância da ilha ao continente. | |
| - | |''Colonization/Area coefficient''|f.i |inclinação da relação linear entre taxa de colonização e área.| | + | |''Colonization/Area coefficient''|f.i |inclinação da relação linear entre taxa máxima de colonização $I$ e a área da ilha.| |
| - | |''Colonization/Distance coefficient''| d.i|inclinação da relação linear entre taxa de colonização e distância. | | + | |''Colonization/Distance coefficient''| d.i|inclinação da relação linear entre taxa máxima de colonização $I$ e a distância da ilha ao continente. | |
| - | |''Ratio Area/Distance effect''| weight.A|peso relativo da área e da distância. Quanto maior o valor maior o efeito da área| | + | |''Ratio Area/Distance effect''| weight.A|peso relativo do efeito da área e da distância sobre as taxas máximas $S$ e $I$. Deve ser um valor entre zero e um. Se o peso é 0.5, o efeito da área de da distância sobre as taxas têm o mesmo peso.| |
| |''Number of Island''| |número de ilhas((apenas para roteiro do RCMDR))| | |''Number of Island''| |número de ilhas((apenas para roteiro do RCMDR))| | ||
| |''Distance''| dist |distância de cada ilha ao continente, em qualquer unidade((na função do R é preciso especificar as distâncias.Ex: dist=c(10,20) ))| | |''Distance''| dist |distância de cada ilha ao continente, em qualquer unidade((na função do R é preciso especificar as distâncias.Ex: dist=c(10,20) ))| | ||
| Linha 309: | Linha 309: | ||
| Varie áreas, distâncias e ambas fornecendo valores diferentes para estes argumentos. Não se preocupe com os demais argumentos, eles estão compatíveis com as escalas de distância e área. Explique a diferença entre os gráficos em termos biológicos. Note que nem sempre as ilhas com mais espécies são as que possuem maior taxa de substituição de espécies. | Varie áreas, distâncias e ambas fornecendo valores diferentes para estes argumentos. Não se preocupe com os demais argumentos, eles estão compatíveis com as escalas de distância e área. Explique a diferença entre os gráficos em termos biológicos. Note que nem sempre as ilhas com mais espécies são as que possuem maior taxa de substituição de espécies. | ||
| + | |||
| + | <WRAP center round tip 60%> | ||
| + | Esta simulação permite incluir efeito da área da ilha sobre a taxa máxima de colonização. Chamamos isso de efeito alvo. Também permite incluir efeito da distância da ilha ao continente sobre a taxa de extinção. Chamamos isso de efeito resgate. | ||
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| + | Caso você não queira incluir estes efeitos, basta indicar valor para para os parâmetros ''Colonization/Distance coefficient'' e ''Extinction/Distance coefficient''. | ||
| + | </WRAP> | ||
| + | |||
| {{ :ecovirt:roteiro:spxareaxdist.jpeg?200|Gráfico 3D da relação espécies-área-distância}} | {{ :ecovirt:roteiro:spxareaxdist.jpeg?200|Gráfico 3D da relação espécies-área-distância}} | ||
ecovirt/roteiro/neutr/biogeo_base.txt · Última modificação: 2023/12/05 13:29 (edição externa)
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