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ecovirt:roteiro:pad_spat

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ecovirt:roteiro:pad_spat [2021/09/20 12:06]
adalardo
ecovirt:roteiro:pad_spat [2021/09/20 12:34]
adalardo [Distribuição Espacial de Palmitos na Restinga]
Linha 64: Linha 64:
 Ambas são abordagens baseadas em pontos, que utilizam o cálculo de distâncias ponto a ponto dentro de uma área delimitada. Essas medidas podem ser usadas para análises univariadas,​ ou seja, identificando o padrão para uma única classe de pontos, ou para análises bivariadas, que identifica o padrão entre dois tipos de pontos. As análises bivariadas podem ser usadas no contexto de populações para verificar se indivíduos de um dado estágio estão espacialmente associados a outro, ou no contexto de estruturação de comunidades para analisar se há atração ou repulsão na ocorrência de uma espécie em relação a outra. ​ Ambas são abordagens baseadas em pontos, que utilizam o cálculo de distâncias ponto a ponto dentro de uma área delimitada. Essas medidas podem ser usadas para análises univariadas,​ ou seja, identificando o padrão para uma única classe de pontos, ou para análises bivariadas, que identifica o padrão entre dois tipos de pontos. As análises bivariadas podem ser usadas no contexto de populações para verificar se indivíduos de um dado estágio estão espacialmente associados a outro, ou no contexto de estruturação de comunidades para analisar se há atração ou repulsão na ocorrência de uma espécie em relação a outra. ​
  
-==== K de Ripley ​(L(r)) ​====+==== K de Ripley ​ ====
 {{:​ecovirt:​roteiro:​ripleys_game.jpg?​100 ​ |}}  {{:​ecovirt:​roteiro:​ripleys_game.jpg?​100 ​ |}} 
  
Linha 87: Linha 87:
   * $n$ é o número de pontos total. ​   * $n$ é o número de pontos total. ​
    
-A interpretação visual do ''​K(r)''​ não é muito intuitiva por ser uma função cumulativa associada à área do criculo de raio ''​r''​. O L de Ripley ​''​L(r)'' ​por sua vez  é a transformação ​deste valor padronizado pela área do circulo associado a ''​r''​+A interpretação visual do ''​K''​ não é muito intuitiva por ser uma função cumulativa associada à área do círculo relativo a ''​r''​. O L de Ripleypor sua vez é a padronização ​deste valor: ​
  
 $$ L_{(r)}= (\sqrt{\frac{K_{(r)}}{\pi}}-r) $$ $$ L_{(r)}= (\sqrt{\frac{K_{(r)}}{\pi}}-r) $$
  
-Desta forma, ​o valor de ''​L(r)''​ para uma distribuição completamente aleatória ​é sempre ''​1''​ e  ''​L(r)>​0''​ indica agregação,​ enquanto ''​L(r)<​0''​ indica padrão homogêneo.+Esta transformação faz com que o valor de ''​L''​ para uma distribuição completamente aleatória ​seja sempre ''​0''​ e  ''​L > 0''​ indica agregação,​ enquanto ''​L < 0''​ indica padrão homogêneo.
  
  
-O $L_{(r)}$ ​ 
  
   ​   ​
Linha 102: Linha 101:
 A estatística **O-ring** é similar ao L de Ripley, mas baseada em um anel, ao invés de um círculo. É medida pela contagem do número de pontos em um anel de raio r e largura fixa. Da mesma forma que o L-Ripley também são calculadas as intensidades para diferentes tamanhos de anel, mantendo a largura fixa.  A estatística **O-ring** é similar ao L de Ripley, mas baseada em um anel, ao invés de um círculo. É medida pela contagem do número de pontos em um anel de raio r e largura fixa. Da mesma forma que o L-Ripley também são calculadas as intensidades para diferentes tamanhos de anel, mantendo a largura fixa. 
  
 +<WRAP center round box 80%>
 {{ :​ecovirt:​roteiro:​o-ring.jpeg?​200 |}} {{ :​ecovirt:​roteiro:​o-ring.jpeg?​200 |}}
 Figura: Implementação da estatística //O-ring//: contagem do número de pontos distantes de //i// ao longo do raio //r//. Extraído de Wiegand & Moloney (2004). Figura: Implementação da estatística //O-ring//: contagem do número de pontos distantes de //i// ao longo do raio //r//. Extraído de Wiegand & Moloney (2004).
 +
 +</​WRAP>​
  
 Logo, definimos $O(r)$ como:  Logo, definimos $O(r)$ como: 
Linha 120: Linha 122:
   * definir quando uma diferença é ou não aceitável para afirmar que o padrão é diferente do aleatório;   * definir quando uma diferença é ou não aceitável para afirmar que o padrão é diferente do aleatório;
  
-Para os dois primeiros tópicos acima, usamos as fórmulas e calculamos os valores. Para tirar a subjetividade do terceiro, podemos calcular intervalos de confiança ou gerar envelopes((equivalente a intervalo de confiança obtido por simulação numérica )) de confiança ​gerados ​por simulações,​ para definir objetivamente o que é algo diferente do esperado.+Para os dois primeiros tópicos acima, usamos as fórmulas e calculamos os valores. Para tirar a subjetividade do terceiro, podemos calcular intervalos de confiança ou gerar envelopes((equivalente a intervalo de confiança obtido por simulação numérica )) de confiança por simulações ​computacionais, para definir objetivamente o que é algo diferente do esperado ​para a CAE.
  
 </​WRAP>​ </​WRAP>​
Linha 301: Linha 303:
  
 Preparamos três arquivos no formato lido pelo //​Programita//:​ Preparamos três arquivos no formato lido pelo //​Programita//:​
-  - dados de indivíduos juvenis (diâmetro do tronco entre 1 e 5 cm): {{:2014:roteiros:​juvenil.dat|}} +  - dados de indivíduos juvenis (diâmetro do tronco entre 1 e 5 cm): {{ :ecovirt:roteiro:​juvenil.dat |}} 
-  - dados de indivíduos adultos (diâmetro do tronco > 5 cm): {{:2014:roteiros:​adulto.dat|}} +  - dados de indivíduos adultos (diâmetro do tronco > 5 cm): {{ :ecovirt:roteiro:adulto.dat |}} 
-  -  juvenis e adultos (padrão 1 adulto, padrão 2 juvenil): {{:2014:roteiros:​juvenil_adulto.dat|}}+  - juvenis e adultos (padrão 1 adulto, padrão 2 juvenil): {{:ecovirt:roteiro:​juvenil_adulto.dat|}}
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ecovirt/roteiro/pad_spat.txt · Última modificação: 2022/09/27 12:40 (edição externa)