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ecovirt:roteiro:neutr:neutrar

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ecovirt:roteiro:neutr:neutrar [2022/10/25 02:31]
127.0.0.1 edição externa
ecovirt:roteiro:neutr:neutrar [2022/10/25 03:28]
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-<WRAP tabs> 
-  * [[ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutrarcmdr|{{:​ecovirt:​logorcmdr01.png?​20|}}]] 
-  * [[ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutrar|{{:​ecovirt:​rlogo.png?​20|}}]] 
-</​WRAP>​ 
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-====== Teoria neutra da biodiversidade - Roteiro no R====== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​teoria_neutra_da_biodiversidade}} 
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-  * [[ecovirt:​roteiro:​math:​bebador|O Bêbado e o Abismo]] 
-  * [[ecovirt:​roteiro:​math:​zerosumr|Um Joguinho Besta]] 
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-====== A Teoria passo a passo ====== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​avisos#​roteiro_r}} 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​a_teoria_passo_a_passo}} 
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-Para simular este processo, temos mais uma super-função no pacote EcoVirtual, chamada ''​simHub1''​ ((além desta, iremos também usar as funções simHub2 e simHub3)). 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​parametros}} 
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-Para realizar as simulações com estes parâmetros,​ copie o comando abaixo e cole na linha de comando do R. Você verá uma animação da dinâmica neutra de mortes e nascimentos. Ao fim dela, você terá um gráfico com o número de espécies na comunidades,​ ao longo do tempo: 
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-   ​simHub1(S = 100, j = 2)  
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​sm_simule}} 
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-Para realizar estas simulações,​ copie e cole os comandos abaixo na linha de comando do R ((O argumento ''​anima=FALSE''​ desliga as animações,​ e aumenta a velocidade de processamento.)) : 
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-<​code>​ 
-simHub1(S = 100, j = 2, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub1(S = 100, j = 4, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub1(S = 100, j = 6, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub1(S = 100, j = 8, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub1(S = 100, j = 10, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub1(S = 100, j = 12, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-</​code>​ 
- 
-==== Questões ==== 
- 
-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​sm_perguntas}} 
- 
-===== Incluindo Migrações ===== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​incluindo_migracoes}} 
- 
-Utilize agora a função **simHub2**,​ que além dos parâmetros da função anterior tem também o parâmetro $m$ para imigração. ​ 
- 
-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​incluindo_migracoes_cont}} 
- 
-Para isto, copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R: 
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-<​code>​ 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.1, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.2, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.3, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.4, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub2(S = 100, j = 2, m = 0.5, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-</​code>​ 
- 
- 
-==== Questões ==== 
- 
-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​incluindo_migracoes_questoes}} 
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-===== Uma Metacomunidade mais Realista ===== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​uma_metacomunidade_mais_realista}} 
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-No pacote EcoVirtual a simulação desta dinâmica neutra com uma metacomunidade que também tem uma dinâmica neutra é feita com a função ''​simHub3''​. 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​parametros_simhub3}} 
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-Para executar estas simulações, ​ copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R: 
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-Para isto, copie e cole os seguintes comandos na linha de comando do R: 
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-<​code>​ 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.1, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.2, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.3, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.4, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-simHub3(S = 100, j = 2, Sm = 200, jm = 20, nu = 1e-9, m = 0.5, anima = FALSE, cycles =2e4) 
-</​code>​ 
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-==== Mais algumas explorações ==== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​exploracoes_simhub3}} 
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-====Questões==== 
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-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​questoes_simhub3}} 
- 
-===== Para saber mais ===== 
- 
-{{section>​ecovirt:​roteiro:​neutr:​neutra_base#​para_saber_mais}} 
- 
- 
-{{tag>R comunidades teoria_neutra}} 
  
ecovirt/roteiro/neutr/neutrar.txt · Última modificação: 2022/10/25 03:28 (edição externa)